Confira abaixo a lista de universidades, institutos federais e Cefet onde já houve intervenção federal na escolha de reitores, seja pela indicação de nomes que não estavam em primeiro na lista enviada ao MEC, ou pela indicação, por parte do presidente, de nomes que não participaram do processo de escolha nas instituições:

1) Centro Federal de Educação Tecnológica do Rio de Janeiro (CEFET-RJ)
2) Universidade da Integração Internacional da Lusofonia Afro-Brasileira (UNILAB)
3) Universidade Federal da Fronteira Sul (UFFS)
4) Universidade Federal da Grande Dourados (UFGD)
5) Universidade Federal do Ceará (UFC)
6) Universidade Federal do Espírito Santo (UFES)
7) Universidade Federal do Recôncavo Baiano (UFRB)
8) Universidade Federal do Semi-Árido (UFERSA)
9) Universidade Federal do Triângulo Mineiro (UFTM)
10) Universidade Federal do Vale do São Francisco (UNIVASF)
11) Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM)
12) Universidade Federal do Sul e Sudeste do Pará (Unifesspa)
13) Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
14) Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro (UNIRIO)
15) Instituto Federal de Santa Catarina (IFSC)
16) Instituto Federal do Rio Grande do Norte (IFRN)
17) Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro (UNIRIO)
18) Universidade Federal da Paraíba (UFPB)
19) Universidade Federal do Piauí (UFPI)

Fonte: ANDES